NCBI []
NCBI (National Center for Biotechnology Information）是同义美国国立生物技术个人信息中都心
EMBL []
国家分子生物学科学实验室EMBL（The European Molecular Biology Laboratory）
DDBJ []
DDBJ(DNA Data Bank of Japan)，于1984年设立，是21世纪四大DNA 样本库之一，与NCBI的GenBank，EMBL的EBI样本库合作组成国际DNA样本库
CNGB []
中都国国家政府样本库（China National GeneBank）地处珠海大鹏从新区，是继21世纪四大样本库以后的全球第四大国家政府级样本库。它是中都国首个，也是唯一一个国家政府蛋白质质库，近似于全球另外三个蛋白质质库而言，国家政府蛋白质质库材料复原的需求量、存储量和可到访的样本量均是全球最大。
BIGD []
中都国国家政府蛋白质质组科学知识样本中都心 从新生命与健康大样本中都心 (National Genomics Data Center BIG Data Center)
2、非编码器RNA样本库（1）.非编码器小RNA样本库miRBase []
piRNAbank []
piRNAbank []
SILVA []
（2）.长非编码器RNA样本库：LncRNAdb []
酿酒酵母生物
LncRNAwiki [_Page]
本能长非编码器RNA样本库
（3）.非编码器RNA表亲样本库Rfam[]
类似于Pfam的RNA表亲正文样本库
（4）.非编码器RNA氨福酸样本库RNAcentral [ ]3、氨福酸样本库（1）.氨福酸个人信息Human protein atlas [ ]
生理蛋白质在蛋白质、其组织、病理前提条件下的传达
（2）.蛋白质氨福酸样本库Pfam []
Pfam是氨福酸表亲的样本库，还包括使用歧马尔可夫三维生成的正文和多氨福酸鉴定。
SwissProt []
手动正文的非冗余蛋白质氨福酸样本库
UniProt [ ]
PIR []
Antibodies []
BRENDA [ ]
HPRD []
InterPro []
通过整合多个蛋白质就其样本库，发放了一个方便的对蛋白质氨福酸顺利完成动态正文的平台，还包括对氨福酸表亲、结构上域、动态细胞核的预报
iProClass []
PRF []
REBASE []
（3）.氨福酸结构上样本库PDB []
通过科学实验测量的结构上
SCOP []
CATH []
PSI []
（4）.蛋白质组样本库PRIDE []（5）.氨福酸动态域样本库PROSITE []
最全面
Pfam []
最专业
ProDom []
CCD []
Prints []
SMART [ ]
TIGRFAM []
（6）.蛋白质互作样本库STRING []
DIP []
科学实验证明的蛋白质相互主导作用样本库
BioGRID [] ：
IntAct [ ]
4、代谢样本库MapMan：一个跨平台的代谢途径查看和撰稿应用软件
（1）.代谢途径样本库KEGG []
GO []
NCBI BioSystems []
IMP []
plantCyc []
MANET [ ]
MetaNetX [ ]
（2）.代谢组学常以样本库MataboLights []
HMDB []
YMDB []
ECMDB []
（3）.表型样本库Planteome []
dbGaP []
IPPN []
5、氨福酸鉴定（1）.氨福酸与样本库鉴定Blast []（2）.多氨福酸两者之间鉴定Clustal（3）.氨福酸进化树归纳MEGA6、蛋白质质归纳（1）.蛋白质质个人信息GeneCard []
Gene Wiki[_Wiki ]
（2）.蛋白质质正文Blast []
Interproscan []，
WEGO []
KAAS []
（3）.蛋白质质动态预报：FGENESH []
AUGUSTUS [ ]
GENESCAN []
GeneMark []
Glimmer []
（4）.蛋白质质结构上预报Exon-Intron Graphic Maker []
根据候选蛋白质质的外显子和内含子等个人信息画蛋白质质结构上
Blastp [_TYPE=BlastSearch&LINK_LOC=blasthome]
可应用软件获取蛋白质结构上域的正文和位置个人信息
（5）.分化成蛋白质质归纳OrthoDB是直系分化成物的先导目录[]（6）.亚蛋白质近似于预报PSORT Prediction []（7）.操纵子归纳Plantcare []（8）.抑制用以蛋白质质的miRNA预报psRNAtarget []（9）.传达归纳ArrayExpress [ ]
样本来自EMBL的高通量动态蛋白质质组学科学实验的样本；
BAR []
在归纳蛋白质质动态时，一般而言会参考蛋白质质的传达方式在，即蛋白质质在植物学不同其组织不同胚胎后期的传达丰度变动。通过应用软件归纳该网站BAR对候蛋白质质顺利完成传达归纳。 是一个植物学生信归纳能源该网站，用该该网站归纳蛋白质质传达时，不仅可以取得蛋白质质传达方式在的热图，还可以取得图形学的电子发射光谱图片，直觉看出蛋白质质在植物学其组织中都的传达位置。
（10）.蛋白质质结构上画GSDS []
Gene Structure Display Server，福于蛋白质质组正文文件画氨福酸蛋白质质结构上等动态
7、氨福酸归纳（1）.蛋白质二级三级结构上预报及绘图CFSSP []SOPMA [_automat.pl?page=npsa_sopma.html]PredictProtein []SWISS-MODEL []（2）.蛋白质结构上归纳ProtParam []
蛋白质结构上归纳是同义蛋白质的一些物理和化学表达式，如分子量、等电点、和原子组成、消光常数、氙、不稳定常数、脂肪族同义数、亲湿热。这些表达式，有助于顺利完成蛋白质的就其生化科学实验。比如在体外法制（大肠杆菌、大肠杆菌等）传达和纯化用以蛋白质时，无需考虑蛋白质的分子量、等电点、消光常数、不稳定常数和亲湿热等。在蛋白酶活科学实验中都，也无需根据这些表达式改进科学实验法制。
（3）.蛋白质亲游离性归纳Protscale []
蛋白质的亲游离性主要由其侧碱福福团R，如果R只是H或是C、H两元素组成的话，都是游离的，如果所含极性侧碱福福团，如-OH、-SH、-COOH、-NH2 等，则就是极性的（水岸的）。游离性有酪氨酸、色氨酸、苯丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、丙氨酸和蛋氨酸（甲硫氨酸）。游离性在氨福酸外部，在保证氨福酸的三级结构上上，蛋白酶和动物细胞、抗体和抗原两者之间的相互主导作用等各种非共价键的分子紧密结合方面，具最重要主导作用。
（4）.包涵骨架上归纳TMHMM []
蛋白质的包涵骨架上归纳对于预报蛋白质的亚蛋白质近似于密切就其。如果具包涵骨架上，蛋白质很意味著近似于于蛋白质中都与薄膜就其的结构上，如蛋白质质薄膜、叶绿体薄膜或细胞质薄膜等内薄膜种系统。此外，蛋白质包涵骨架上归纳对于蛋白质动态归纳也有一定的帮助。比如某蛋白质很难包涵骨架上，但是亚蛋白质近似于科学实验显示其可近似于于薄膜就其结构上，这暗示该蛋白质意味著通过其他薄膜近似于蛋白质招募过去的。
（5）.接收机肽归纳SignalP []
峰顶接收机位置为接收机肽切割点，峰顶前的氨福酸为接收机肽
接收机肽是同义为了让从新还原的氨福酸向腺体渠道转移的较短肽碱福，常地处蛋白质的N-外侧，负责把氨福酸为了让到不同骨架上的亚蛋白质器内。编码器腺体蛋白质的mRNA在翻译时首先还原N外侧的接收机肽，它被接收机肽鉴别蛋白质(SRP)所鉴别，SRP将细胞核装载至液泡上，液泡薄膜上的 SPR 受体鉴别并与之紧密结合。从新还原蛋白质在接收机肽为了让下到达液泡内腔，而接收机肽则在接收机肽蛋白酶的主导作用下被切除。由于它的为了让，从新生的就能够通过液泡薄膜进入腔内，再一被腺体到胞外。在消化道菌中都传达经年累月蛋白质时，只用接收机肽为了让经年累月蛋白质近似于腺体到胞外，提高蛋白质镁，在原核传达种系统（大肠杆菌、芽孢杆菌等）和酿酒酵母传达种系统（如毕赤大肠杆菌）中都均有应用于。
（6）.一氧化氮细胞核归纳NetPhos []
KinasePhos-2.0 []
氨福酸一氧化氮同义由氨福酸激蛋白酶催化重排的把 ATP 的氨基福转移只不过物氨福酸残福（赖氨酸、选择性、酪氨酸）上的操作过程，或者在接收机主导作用下紧密结合 GTP（一般而言以 GTP 取代 GDP），是生物体内一种普通的调节方式，在蛋白质接收机转导的操作过程中都起最重要主导作用。在接收机远超时通过取得一个或几个氨基上市公司而被作用于，而在接收机减弱时能去除这些上市公司，从而失去活性。有时某个接收机蛋白质一氧化氮一般而言造成下游的蛋白质分作发生一氧化氮，呈现出一氧化氮级联重排。
二、生物个人信息学应用软件及下载碱福接：
Clustal:
MEGA:
MAFFT:
Sequence Matrix:
PGDSpider:
DnaSP v6:
Arlequin:
MapMan：
PartitionFinder:
jModelTest:
IQ-TREE:
IQ-TREE应用软件:
RaxmlGUI:
Mrbayes 3.2.7:
PhyloSuite:
BEAST:
Figtree:
Tracer:
PopART:
Network:
Structure:
CLUMMP:
Distruct:
Migrate-N:
Phylonet: 或
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